Agnes war schon als Kind eine ausgeprägte Atomkraftgegnerin, studierte internationale Entwicklung und Europa Studien in Berlin und lebte lange im Ausland Warschau, Berlin, Nowosibirsk und Kiew, wo sie als politische Referentin für den OSZE-Vorsitz Österreichs in der Österreichischen Botschaft tätig war.  Diplomatischen Arbeit auch zivilgesellschaftlicher Aktivismus sind ihr nicht fremd. In Berlin setzte sie sich als Geschäftsführerin bei Amaro Foro e.V. für junge Roma und Nicht-Roma ein.

Seit Anfang des Jahres ist Agnes Zauner  politische Geschäftsführerin von GLOBAL 2000 in Österreich.